Anja Seeger wuchs in Süddeutschland auf, lebte von ihrem 14. bis 24. Lebensjahr in Kanada und studierte dann von 1990 bis 1995 Architektur in Oldenburg.

Sie absolvierte währenddessen diverse Praktika, unter anderem bei dem renommierten Mark Mack in San Francisco und Los Angeles, Kalifornien.

Nach dem Diplom arbeitete sie zunächst als freie Mitarbeiterin in zwei Architekturbüros in Berlin.

Im Jahr 2000 gründete sie die Firma Baufase Berlin, mit der sie sich auf Altbaurenovierung spezialisierte.